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蛋白质组学技术汇总

        蛋白质组最早由Marc Wilkins 在1994年提出,它指由一个基因组,或一个细胞、组织表达的所有蛋白质。与基因组不同,蛋白质组是一个动态的概念,不同物种、不同生物个体以及同一生物体在不同发育阶段或不同实验条件下,其表达的蛋白质都会不同。
        我公司提供以下多种蛋白质组学技术,这些技术广泛应用于蛋白质的定性和定量分析。


蛋白质定性分析
技术类型 技术特点 适用样本
MALDI-TOF/TOF 鉴定单一组分的蛋白样本 双向电泳(2DE)胶点
LC-MS/MS 鉴定复杂组分的蛋白样本 胶点、胶条、蛋白溶液或干粉等
 
蛋白质相对定量分析(差异蛋白质组技术——对大量蛋白质进行定量分析)
技术类型 技术特点 适用样本
iTRAQ iTRAQ试剂体外标记肽段,采用液质联用法定性和定量蛋白质,最多同时分析8组样本的蛋白表达谱 各种类型的样本,包括:
动物组织(肌肉、内脏、皮肤、软骨、神经节等);
植物组织(根、茎、叶、花、果实、种子);
细胞(原代或传代细胞、精子、卵子);
微生物(细菌、真菌);
体液(血清、血浆、脑脊液、汗液、尿液、唾液、房水等)
TMT TMT试剂体外标记肽段,采用液质联用法定性和定量蛋白质,最多同时分析10组样本的蛋白表达谱
Label-free 非标法,采用液质联用方法分离蛋白质,通过一级质谱峰峰强和峰面积定量蛋白质,二级质谱峰信息定性蛋白质,对分析组数无限制
双向电泳 非标法,采用凝胶法分离蛋白质,根据胶点灰度值和面积定量蛋白质,对分析组数无限制
DIGE 荧光标记蛋白,采用凝胶法分离蛋白质,根据胶点灰度值和面积定量蛋白质;引入内标匹配与校正,定量更准确,对分析组数无限制
SILAC 体内标记法,细胞在传代培养过程中摄入稳定同位素氨基酸,标记率几乎可达100%,可同时分析3组样本的蛋白表达谱。 可传代培养的细胞
 
蛋白质相对定量分析(对特定蛋白质进行定量分析)
技术类型 技术特点
Western-blot 利用抗体检测某个特定蛋白质在多个样本间的相对表达水平差异
PRM 对质谱中目标蛋白质的特征肽段进行选择性检测,实现对目标蛋白或肽段的相对定量
 
蛋白质绝对定量分析
技术类型 技术特点
PRM 通过合成特征肽段的标准品,实现对目标蛋白或肽段的绝对定量
Luminex芯片 又称液相芯片分析、流式荧光分析,以抗体为基础,能实现100个指标的高通量检测
 
生物信息学分析
技术类型 技术特点
GO分析 从分子功能、细胞位置、生物学过程三个方面对蛋白质进行注释、分类和富集分析
KEGG pathway分析 对蛋白质参与的最主要生化代谢途径和信号转导途径进行注释、分类和富集分析。
String分析 利用String数据库分析蛋白质之间直接或间接的联系。

 
我们的服务优势:
        我公司目前已经成功完成了超过10000张双向电泳/DIGE凝胶、50000多个蛋白质质谱鉴定及上百例iTRAQ、SILAC服务,检测样本涵盖数十个物种,如人、鼠、兔、鸡、猪、水稻、棉花、大麦、葡萄、香蕉、杨树、血吸虫、弓形虫、线虫、蓝藻、大肠杆菌、嗜血流感菌、衣原体等等。客户在J Proteome Res、J Proteomics、Proteomics等蛋白质组专业期刊上发表了数十篇SCI文章。
点击查看客户发表SCI论文

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