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蛋白质组学技术汇总

蛋白质组最早由Marc Wilkins 在1994年提出,它指由一个基因组,或一个细胞、组织表达的所有蛋白质。与基因组不同,蛋白质组是一个动态的概念,不同物种、不同生物个体以及同一生物体在不同发育阶段或不同实验条件下,其表达的蛋白质都会不同。

蛋白质组学在研究有关生命活动的分子机理中,同样有着不可取代的地位。蛋白质组学研究的一般思路可简单概括为以下流程图。

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我公司提供以下多种蛋白质组学技术,这些技术广泛应用于蛋白质的定性和定量分析。


蛋白质定量分析

技术类型

技术特点

适用样本

MALDI-TOF/TOF

鉴定单一组分的蛋白样本

双向电泳(2DE)胶点

LC-MS/MS

鉴定复杂组分的蛋白样本

胶点、胶条、蛋白溶液或干粉等

 

白质相对定量分析(差异蛋白质组技术——对大量蛋白质进行定量分析)

技术类型

技术特点

适用样本

iTRAQ

iTRAQ试剂体外标记肽段,采用液质联用法定性和定量蛋白质,最多同时分析8组样本的蛋白表达谱

各种类型的样本,包括:
动物组织(肌肉、内脏、皮肤、软骨、神经节等);
植物组织(根、茎、叶、花、果实、种子);
细胞(原代或传代细胞、精子、卵子);
微生物(细菌、真菌);
体液(血清、血浆、脑脊液、汗液、尿液、唾液、房水等)

TMT

TMT试剂体外标记肽段,采用液质联用法定性和定量蛋白质,最多同时分析10组样本的蛋白表达谱

Label-free

非标法,采用液质联用方法分离蛋白质,通过一级质谱峰峰强和峰面积定量蛋白质,二级质谱峰信息定性蛋白质,对分析组数无限制

双向电泳

非标法,采用凝胶法分离蛋白质,根据胶点灰度值和面积定量蛋白质,对分析组数无限制

DIGE

荧光标记蛋白,采用凝胶法分离蛋白质,根据胶点灰度值和面积定量蛋白质;引入内标匹配与校正,定量更准确,对分析组数无限制

SILAC

体内标记法,细胞在传代培养过程中摄入稳定同位素氨基酸,标记率几乎可达100%,可同时分析3组样本的蛋白表达谱。

可传代培养的细胞

 

蛋白质相对定量分析(对特定蛋白质进行定量分析)

技术类型

技术特点

Western-blot

利用抗体检测某个特定蛋白质在多个样本间的相对表达水平差异

PRM

对质谱中目标蛋白质的特征肽段进行选择性检测,实现对目标蛋白或肽段的相对定量

 

蛋白质绝对定量分析

技术类型

技术特点

PRM

通过合成特征肽段的标准品,实现对目标蛋白或肽段的绝对定量

Luminex芯片

又称液相芯片分析、流式荧光分析,以抗体为基础,能实现100个指标的高通量检测

 

生物信息学分析

技术类型

技术特点

GO分析

从分子功能、细胞位置、生物学过程三个方面对蛋白质进行注释、分类和富集分析

KEGG pathway分析

对蛋白质参与的最主要生化代谢途径和信号转导途径进行注释、分类和富集分析。

String分析

利用String数据库分析蛋白质之间直接或间接的联系。


服务优势


辉骏生物目前已经成功完成了超过10000张双向电泳/DIGE凝胶、50000多个蛋白质质谱鉴定及上百例iTRAQ、SILAC服务,检测样本涵盖数十个物种,如人、鼠、兔、鸡、猪、水稻、棉花、大麦、葡萄、香蕉、杨树、血吸虫、弓形虫、线虫、蓝藻、大肠杆菌、嗜血流感菌、衣原体等等。客户在J Proteome Res、J Proteomics、Proteomics等蛋白质组专业期刊上发表了数十篇SCI文章。


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