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ChIP

技术概述 
ChIP-Seq是研究体内蛋白与DNA互作的重要技术。该技术先用甲醛等试剂交联固定细胞内的“蛋白-DNA”复合物,裂解并超声处理细胞,用目的蛋白特异的抗体(或标签抗体)做免疫沉淀,获取“目的蛋白-DNA”的复合物,去交联分离复合物中的DNA做高通量测序,即可找到可能与目的蛋白互作的DNA序列。
 

技术应用

转录因子结合位点及组蛋白修饰研究等。

 
技术流程 






服务信息


项目名称 客户提供 结果交付
ChIP-qPCR
 
1. 蛋白信息(物种、序列)
2. 蛋白抗体
3. 细胞系及培养信息
4. 待验证的基因信息(物种、序列)
1. 原始结果图(包括Input、阳性及阴性对照结果)
2. qPCR结果;
3. 完整实验报告(包括实验材料、方法、结果分析)
ChIP-seq 1. 蛋白信息(物种、序列)
2. 蛋白抗体
3. 细胞系及培养信息
1. 原始结果图(input和洗脱液的SDS-PAGE图)
2. 高通量测序结果
3. 完整实验报告(包括实验材料、方法、结果分析)
 

参考文献

1.Diverse transcription factor binding features revealed by genome-wide ChIP-seq in C. elegans. Genome Res 21(2):245-254(2011).
       
2.Role of ChIP-seq in the discovery of transcription factor binding sites, differential gene regulation mechanism, epigenetic marks and beyond. Cell Cycle 13(18):2847-2852(2014).
       
3.ChIP-seq reveals the global regulator AlgR mediating cyclic di-GMP synthesis in Pseudomonas aeruginosa. Nucleic Acids Res 43(17):8268-8282(2015).
       
4.Liver ChIP-seq analysis in FGF19-treated mice reveals SHP as a global transcriptional partner of SREBP-2. Genome Biol 16:26(2015)8.


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