一、技术概述 RIP是研究体内蛋白与RNA互作的重要技术。该技术先用甲醛等试剂交联细胞内的“蛋白-RNA”互作复合物,裂解细胞后,用靶蛋白特异的抗体(或标签抗体)做免疫沉淀,获得“靶蛋白-RNA”互作复合物,去交联分离其中的RNA;针对预测的靶蛋白结合RNA的序列设计引物,做qPCR实验,验证预测的RNA是否与靶蛋白有结合;或者将分离出来的RNA做高通量测序,筛选到可能与靶蛋白结合的RNA。 二、技术应用 目的蛋白的互作RNA筛选。 三、技术流程 细胞交联→细胞裂解→免疫共沉淀→去交联→RNA分离→建库→高通量测序(或qPCR)。 四、服务信息
五、参考文献 1.RIP: RNA Immunoprecipitation. Methods MolBiol 1480:73-86 (2016). 2.Mitochondrial iron chelation ameliorates cigarette smoke-induced bronchitis and emphysema in mice. Nat Med 22(2):163-174(2016). 3.Identification and dynamic changes of RNAs isolated from RALY-containing ribonucleoprotein complexes. Nucleic Acids Res(2017). |