技术概述
RIP是研究体内蛋白与RNA互作的重要技术。该技术先用甲醛等试剂交联细胞内的“蛋白-RNA”互作复合物，裂解细胞后，用靶蛋白特异的抗体（或标签抗体）做免疫沉淀，获得“靶蛋白-RNA”互作复合物，去交联分离其中的RNA；针对预测的靶蛋白结合RNA的序列设计引物，做qPCR实验，验证预测的RNA是否与靶蛋白有结合；或者将分离出来的RNA做高通量测序，筛选到可能与靶蛋白结合的RNA。
技术应用
目的蛋白的互作RNA筛选。
技术流程
服务内容
|
项目名称 |
客户提供 |
结果交付 |
RIP-qPCR
|
1. 蛋白信息（物种、序列）
2. 蛋白抗体
3. 细胞系及培养信息
4. 待验证的基因信息（物种、序列） |
1. 原始结果图（包括Input、阳性及阴性对照结果）
2. qPCR结果；
3. 完整实验报告（包括实验材料、方法、结果分析） |
|
RIP-seq |
1. 蛋白信息（物种、序列）
2. 蛋白抗体
3. 细胞系及培养信息 |
1. 原始结果图（input和洗脱液的SDS-PAGE图）
2. 高通量测序结果
3. 完整实验报告（包括实验材料、方法、结果分析） |
参考文献
1.RIP: RNA Immunoprecipitation. Methods MolBiol 1480:73-86 (2016).
2.Mitochondrial iron chelation ameliorates cigarette smoke-induced bronchitis and emphysema in mice. Nat Med 22(2):163-174(2016).
3.Identification and dynamic changes of RNAs isolated from RALY-containing ribonucleoprotein complexes. Nucleic Acids Res(2017).
|
