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RIP

技术概述     
RIP是研究体内蛋白与RNA互作的重要技术。该技术先用甲醛等试剂交联细胞内的“蛋白-RNA”互作复合物,裂解细胞后,用靶蛋白特异的抗体(或标签抗体)做免疫沉淀,获得“靶蛋白-RNA”互作复合物,去交联分离其中的RNA;针对预测的靶蛋白结合RNA的序列设计引物,做qPCR实验,验证预测的RNA是否与靶蛋白有结合;或者将分离出来的RNA做高通量测序,筛选到可能与靶蛋白结合的RNA。
 


技术应用

目的蛋白的互作RNA筛选。
 

技术流程   



服务内容
项目名称 客户提供 结果交付
RIP-qPCR
 
1. 蛋白信息(物种、序列)
2. 蛋白抗体
3. 细胞系及培养信息
4. 待验证的基因信息(物种、序列)
1. 原始结果图(包括Input、阳性及阴性对照结果)
2. qPCR结果;
3. 完整实验报告(包括实验材料、方法、结果分析)
RIP-seq 1. 蛋白信息(物种、序列)
2. 蛋白抗体
3. 细胞系及培养信息
1. 原始结果图(input和洗脱液的SDS-PAGE图)
2. 高通量测序结果
3. 完整实验报告(包括实验材料、方法、结果分析)
 

参考文献

1.RIP: RNA Immunoprecipitation. Methods MolBiol 1480:73-86 (2016).


2.Mitochondrial iron chelation ameliorates cigarette smoke-induced bronchitis and emphysema in mice. Nat Med 22(2):163-174(2016).
       
3.Identification and dynamic changes of RNAs isolated from RALY-containing ribonucleoprotein complexes. Nucleic Acids Res(2017).

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