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核酸-蛋白相互作用技术汇总

        核酸与蛋白互作不仅是生物有机体展示其生命活动的基本形式之一,还是核酸和蛋白功能阐释的重要内容。
        核酸-蛋白互作研究按照实验内容可分为两大类,一是验证或筛选某条核酸序列(RNA或DNA)的结合蛋白,二是验证或筛选某个兴趣蛋白的结合RNA或DNA。
        我公司提供以下多种技术,帮助研究者们解析生物体内核酸与蛋白质之间的相互作用网络。


验证或筛选某条RNA/DNA的结合蛋白
技术类型 技术特点 适用样本
RNA pull-down 用生物素标记RNA,链霉亲和素磁珠捕获体外条件下结合的靶RNA-蛋白质复合物,Western Blot技术检测目的蛋白和靶RNA是否结合,或质谱技术鉴定复合物中的蛋白质成分 细胞
DNA pull-down 用生物素标记DNA,链霉亲和素磁珠捕获体外条件下结合的靶DNA片段-蛋白质复合物,Western Blot技术检测目的蛋白和靶DNA位点是否结合,或质谱技术鉴定复合物中的蛋白质成分 细胞
ChIRP 用特异的核酸探针捕获体内条件下结合的靶RNA-蛋白质复合物,Western Blot技术检测目的蛋白和靶RNA是否结合,或质谱技术鉴定复合物中的蛋白质成分 细胞
双荧光素酶检测启动子和转录因子的结合 将待测启动子构建到荧光素酶(Luc)基因上游,将构建好的Luc载体和转录因子表达载体共转染细胞,检测Luc活性,从而判断转录因子与目标启动子是否有相互作用 细胞
 
验证或筛选某个兴趣蛋白的结合RNA/DNA
技术类型 技术特点 适用样本
RIP 用诱饵蛋白抗体捕获体内条件下的诱饵蛋白与RNA复合物,采用qPCR技术检测诱饵蛋白与目的RNA是否结合,或采用高通量测序技术获得与诱饵蛋白结合的RNA序列 细胞
ChIP 用诱饵蛋白抗体捕获体内条件下的诱饵蛋白与DNA片段的复合物,采用qPCR技术检测诱饵蛋白与目的DNA位点是否结合,或采用高通量测序技术获得与诱饵蛋白结合的DNA位点序列 细胞
 
 

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