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代谢组:LC/GC-MS

技术简介

代谢组是指在特定生理时期或处理条件下,某一生物体或细胞内包含的所有低分子量(<1000Da)代谢产物。代谢组学是对这些产物进行定性和定量分析的科学。

代谢组学研究按照研究目的可分为非靶向代谢组学和靶向代谢组学。非靶向代谢组学是对生物体内源性代谢物进行系统全面的分析,以寻找差异代谢物(代谢谱分析);靶向代谢组学则是针对特定的某一类代谢物进行分析。

目前常用的代谢组学研究方法有:液相色谱-质谱联用(LC-MS)、气相色谱-质谱联用(GC-MS)等。



应用领域


疾病诊断、药物代谢机理及毒理研究、动植物抗病抗逆机理研究等。



技术流程(非靶向代谢)


代谢物提取——代谢物衍生化(GC-MS需要)——上机检测——数据统计分析——差异代谢物筛选——KEGG pathway分析

辉骏生物:非靶向代谢技术流程



技术特点


1. LC-MS法灵敏度较高,较宽动态范围,无需衍生化,更适用于分析难挥发或热稳定性差的代谢物;缺点是标准谱图库信息不全,不易定性。


2. GC-MS法分辨率高,灵敏度高,有比较标准的数据库,易于定性,可检测样本中大多数有机和部分无机分子;缺点是需要衍生化,预处理繁琐。


参考文献


1.Metabolomic analysis of the effects of cadmium and copper treatment in Oryza sativa L. using untargeted liquid chromatography coupled to high resolution mass spectrometry and all-ion.

2.fragmentation. Metallomics.9(6):660-675(2017).

3.Metabolic biomarker signature to differentiate pancreatic ductal adenocarcinoma from chronic pancreatitis. Gut, pii: gutjnl-2016-312432 (2017).

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