RNA pull down银染后条带背景深需考虑是不是SDS-PAGE染色时间过长或者抗体的质量问题，多克隆抗体经常会出现这种情况，最有可能的情况是样品中包含的非特异性蛋白太多了，针对这一点，有以下解决措施：
1.优化孵育时间、温度、盐浓度等条件；

2.优化缓冲体系，使用严谨性高的缓冲体系；

3.提高裂解液的质量。