IP是在已知一种蛋白质的抗体情况下，直接用这种抗体将目标蛋白质提取出来，是一种提纯蛋白质的方法。

免疫共沉淀（CoIP）主要用于检测蛋白质与蛋白质之间连接作用，如你想检测蛋白质A与蛋白质B之间是否有相互作用，你手中又有蛋白质A的特异抗体，就将蛋白质A和抗体加入到含有蛋白质B的细胞解液中去，利用抗体提纯，如果蛋白质A，B之间有相互作用，则最后提纯产物是抗体——蛋白质A——蛋白质B。由于最后终产物是多种蛋白质复合物，所以这种技术叫做co-immunoprecipitation，和IP的用途区别还是很大的。