染色质的修饰对于调节几乎所有以 DNA 为模板的生物过程至关重要。  单细胞染色质修饰谱可用于评估染色质修饰，这可以提供表观遗传变化和生理变化之间的关系。

染色质修饰

染色质修饰是通过共价组蛋白修饰和核小体修饰实现的。 组蛋白 乙酰化 、去乙酰化、甲基化和磷酸化是共价组蛋白修饰的形式，由组蛋白乙酰转移酶 (HAT)、组蛋白去乙酰化酶 (HDAC)、组蛋白甲基转移酶 (HNMT) 和激酶等酶进行。 由 DNA 甲基转移酶 (DNMT) 进行的 DNA 甲基化和由激酶进行的 DNA 磷酸化是核小体修饰的形式。 染色质重塑对于调节基因表达和其他调节过程很重要，例如卵细胞 DNA 复制和修复、细胞凋亡和染色体分离。

染色质修饰分析的类型

染色体免疫沉淀测序

染色体免疫沉淀测序 (ChIP-seq) 可以分析蛋白质与 DNA 的相互作用，并提供有关表观遗传变化的信息。  ChIP-seq实验服务涉及将蛋白质与 DNA 交联，然后通过超声处理进行 DNA 片段化。  然后添加珠连接抗体以免疫沉淀靶蛋白。

染色质免疫沉淀定量PCR分析

染色质免疫沉淀定量 PCR 分析 (ChIP-qPCR) 可用于评估已知基因组结合位点的蛋白质-DNA 相互作用。  当位点未知时，可以针对潜在的调控区域（例如启动子）设计 qPCR 引物。   ChIP-qPCR 具有与标准 ChIP-qPCR 非常相似的程序，但在 ChIP-qPCR 实验结束时，得到的 DNA 会进行 qPCR，然后进行分析。

辉骏生物提供的ChIP染色质免疫共沉淀服务分为以下两种：

1. ChIP qPCR实验，用于检测某样本中的诱饵蛋白和待测DNA片段是否结合；

2. ChIP seq实验，用于筛选某样本中的诱饵蛋白可以结合哪些DNA区域。

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ChIP服务优势*辉骏生物

质谱

质谱流式细胞仪结合了流式细胞仪和质谱仪，用于辨别细胞的特性。  抗体与纯元素结合，用于标记细胞蛋白。  然后将细胞雾化并通过氩等离子体将抗体电离。  产生的金属信号由质谱仪分析。  该方法用于分析染色质修饰。

LC-MS/MS蛋白质谱鉴定应用范围

★IP，Co-IP，Pull-down类蛋白相互作用样本（胶条或溶液）的鉴定；

★细胞器，外泌体等简单样本中的所有表达蛋白质的鉴定（全谱分析）。

LC-MS/MS质谱鉴定服务信息-辉骏生物

使用染色质修饰 Pprofiling 进行的发现

老化

最近，随着年龄的增长，观察到表观遗传变异的数量增加。   多重质谱流式分析用于在单细胞水平上分析原代人类免疫细胞中染色质修饰的水平。   对年轻人和老年人进行了差异分析，结果表明，衰老表明个体之间的异质性增加，染色质修饰的细胞间变异性增加。  这些发现显示了年龄对染色质修饰的影响。

乳腺癌

在乳腺癌模型的恶性转化过程中发现了表观遗传变化。通过在乳腺上皮细胞中表达三种癌基因来制作乳腺癌模型。  进行了 ChIP 分析，然后进行了组蛋白甲基化的下一代测序。   使用蛋白质印迹、定量逆转录酶 PCR (qRT-PCR) 和免疫染色来确定基因表达。   该研究发现，在乳腺癌模型中，参与抑制某些癌基因的两个组蛋白标记减少了。

免疫抑制

SUMOylation 是一种转录后修饰，涉及各种细胞过程，例如转录调节、细胞凋亡、蛋白质稳定性和细胞周期进程。  人类有 3 种 SUMO 蛋白（SUMO-1 和 SUMO-2/3）。  一项研究发现，疱疹病毒（卡波西肉瘤相关疱疹病毒 (KSHV)）已经进化出直接和间接调节 SUMO 机制以避免宿主免疫系统的机制。  进行的 ChIP-seq 实验发现 KSHV 重新激活后 SUMO-2/3 显着增加。   基因本体分析发现了参与细胞免疫反应和细胞因子信号传导的基因。  KSHV 通过增加 SUMO-2/3 的转录以阻碍免疫反应来避免免疫系统。

结论

染色质修饰的分析使我们能够更好地了解某些生物过程和疾病。  进一步的研究将提供更多关于有益染色质变化的知识。