中文标题:WTAP介导的m6A修饰稳定PDIA3P1,并促进组蛋白乳酸化诱导的食管鳞癌肿瘤发展
发表期刊: Advanced Science
中科院分区:1区
影响因子:14.1
发表时间:2025年6月
合作单位:皖南医学院第一附属医院
运用产品:生物素RNA pull-down试剂盒和F2-RNA pull-down试剂盒(由辉骏生物提供产品和技术支持)
2025年6月,皖南医学院第一附属医院的研究人员使用辉骏生物生物素RNA pull-down试剂盒和F2-RNA pull down试剂盒发表文章,该研究发现lncRNA“PDIA3P1”在食管鳞状细胞癌(ESCC)中高表达,通过调节糖酵解产生更多的乳酸,上调乳酸化水平以驱动肿瘤进展。机制研究表明,lncRNA PDIA3P1通过与miR-152-3p竞争结合,阻止GLUT1 mRNA的降解来增强其水平,并破坏MARCH8(膜相关的RING-CH8)和HK2(己糖激酶2)之间的结合,以减少HK2的泛素化降解,促进糖酵解。PDIA3P1还上调了组蛋白H4K8乳酰化(H4K81a)的水平并促进BMP7(骨形态发生蛋白7)转录,最终推动ESCC进展。此外,Wilms肿瘤1相关蛋白(WTAP)介导的m6A修饰通过IGF2BP1(胰岛素样生长因子2 mRNA结合蛋白1)依赖性识别增强了PDIA3P1的稳定性。这些发现揭示了PDIA3P1对糖酵解-H4K81a-BMP7信号轴的调控在ESCC进展中的关键作用,并为代谢重编程和表观遗传调控之间的相互作用提供了新的见解。
1. 研究发现lncRNA“PDIA3P1”在ESCC组织及细胞系中高表达。RNA-seq结果揭示其与糖酵解相关。
2. 生物信息学分析了靶向PDIA3P1的5种miRNA,AGO2蛋白的RIP-qPCR实验证实miR-152-3p的富集最为显著,研究者使用辉骏生物“生物素RNA pull-down试剂盒”进行miRNA pull-down实验,发现PDIA3P1可以结合miR-152-3p(图1K)。
3. 进一步发现PDIA3P1敲低显著下调了糖酵解关键酶:葡萄糖转运蛋白1(GLUT1)和己糖激酶2(HK2)的蛋白水平,且二者是PDIA3P1的下游靶点。
4. 机制解析表明,一方面,PDIA3P1通过结合miR-152-3p,减少其对GLUT1 mRNA的降解,从而维持GLUT1的稳定性和表达水平。另一方面,PDIA3P1直接结合HK2,阻断E3泛素连接酶MARCH8对HK2的泛素化降解,提高其蛋白稳定性。这两方面共同激活了糖酵解关键节点,加速了乳酸的积累。
5. CUT&Tag和RNA-seq实验筛选出了H4K8la的潜在靶基因BMP7(骨形态发生蛋白7),功能验证实验发现,BMP7是PDIA3P1驱动ESCC进展的下游靶点,调控ESCC的肿瘤进展;
6. 此前研究发现其他癌症中PDIA3P1出现了大量的m6A富集峰;SRAMP预测、MeRIP-qPCR显示、TCGA数据库分析、qRT-PCR实验发现PDIA3P1在ESCC中存在显著的m6A修饰,并且其表达水平与m6A甲基转移酶WTAP呈正相关;
7. 研究者使用辉骏生物“F2-RNA pull down试剂盒”证实,PDIA3P1与WTAP之间存在直接相互作用(图2H,I),WTAP通过m6A修饰调控PDIA3P1的RNA稳定性,且m6A阅读器IGF2BP1是稳定PDIA3P1的关键因子,WTAP/IGF2BP1依赖的m6A修饰是PDIA3P1高表达的关键机制。
综上所述,本研究揭示了PDIA3P1在ESCC中作为代谢-表观调控枢纽的重要功能:一方面通过ceRNA机制和蛋白互作增强糖酵解,诱导乳酸依赖的组蛋白乳酰化,促进BMP7转录;另一方面通过WTAP/IGF2BP1介导的m6A修饰维持自身稳定性和表达水平。这一发现不仅拓展了对ESCC发病机制的认识,也为靶向代谢重编程与表观修饰的联合治疗策略提供了新靶点。
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