出现垂直条纹的原因有很多，引起的现象也会有所区别，比如蛋白没有被SDS充分包裹引起的横条纹会在整个区域都出现，适当延长平衡时间以及准确配置各种溶液可以解决该问题；而Tris-HCL的PH值错误也会引起垂直条纹，该条纹呈现下雨状，并且在中上部会有明显的分界线，准确调配PH值可以很好地解决这个问题；此外，样品中含有杂质，比如DNA等也会引起条纹的产生。