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影响因子:28.467 期刊 :Nature Methods 合作技术:LC-MS/MS蛋白质谱鉴定
【研究内容】:该研究开发了一种分离 RNA 结合蛋白的新技术——RICK(Newly Transcribed RNA interactome using click chemistry):用EU(ethynyluridine)来标记细胞内的RNA,再将EU生物素化,利用核酸标记,将新合成的RNA标记上生物素,最后通过链霉亲和素偶联的磁珠,分离得到相应被标记RNA分子和与其相结合的蛋白分子,包括非polyA RNA和新生RNA在内的一系列RNA分子及其结合蛋白。RICK将促进对不同细胞和系统中总rnA结合蛋白质组的深入研究。
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影响因子:4.362 期刊 :Oncol Res 合作技术:慢病毒载体构建,慢病毒包装,稳转细胞株构建
【研究内容】:本研究首次探讨了Maff在HCC中的作用,并揭示了一个新的circ-ITCH/miR-224-5p/MafF调控通路。研究发现Maff在肝癌组织和细胞中呈下降趋势,慢病毒介导的Maff过表达抑制肝癌细胞增殖,诱导细胞凋亡。RNA pull down实验表明,CIRC-itch能特异性地结合肝癌组织中的miR-224-5p;救治实验进一步阐明Maff的表达和抗肿瘤作用可能是通过CIRC-itch/miR-224-5p轴来调节的。研究证实了Maff在肝癌中的抑癌作用,为肝癌的潜在治疗靶点提供了新的视角。
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影响因子:4.831 期刊 :Aging-US 合作技术:载体构建
【研究内容】:某些基质金属蛋白酶(MMP)的高表达与癫痫密切相关。本研究发现ILF3-AS1在颞叶癫痫(TLE)患者的海马和血清中水平升高,ILF3-AS1通过靶向miR-212诱导炎性细胞因子和MMP3、MMP9的表达。值得注意的是,针对ILF3-AS1/miR212/MMP3/9轴的治疗策略可能是治疗TLE的有效方法。
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影响因子:5.168 期刊 :Oncotarget 合作技术:载体构建
【研究内容】:这项研究发现癌症易感候选基因CASC9在胃癌组织中的高表达与侵袭性病理特征有关。在对紫杉醇和阿霉素耐药的BGC823/DR和SGC7901/DR细胞中,CASC9的表达水平更高。敲除CASC9基因可抑制BGC823/DR和SGC7901/DR细胞的增殖,促进细胞凋亡。此外,在BGC823/DR和SGC7901/DR细胞中,CASC9基因敲除后恢复了对紫杉醇和阿霉素的化疗敏感性。这与多药耐药1(MDR1)蛋白表达降低有关。研究结果提示,lncRNA CASC9的表达与胃癌的侵袭性病理特征有关,可能成为调控胃癌细胞增殖、侵袭和化疗耐药的潜在癌基因。
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影响因子:5.314 期刊 :Molecular Oncology 合作技术:慢病毒包装
【研究内容】:作者发现FEN1在肺癌细胞中高表达,是碱基切除修复通路的重要组分,在维持基因组稳定性方面发挥重要作用。FEN1对肺癌细胞增殖来说很关键,抑制FEN1会导致DNA复制能力下降和DNA损伤积累,最终引发凋亡。FEN1量的改变还会影响肺癌细胞对化疗药物的响应。在小鼠实验中,FEN1抑制剂的使用也能够阻碍肺癌的发展。因此,该研究指出FEN1的有效利用可能会为肺癌靶向治疗提供帮助。
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影响因子:6.304 期刊 :Cell Death and Disease 合作技术:载体构建
【研究内容】:本研究发现,人黑色素瘤中TLR4的表达与STAT3的激活/磷酸化呈正相关,TLR4配体通过MYD88和TRIF激活黑色素瘤细胞中的STAT3,促进了肿瘤的生长、血管生成、上皮-间充质转化(EMT)和免疫抑制肿瘤微环境的形成。当抑制黑色素瘤中STAT3的功能时,TLR4激活产生的效应减弱,说明STAT3激活对TLR4信号介导的黑色素瘤发展至关重要,为黑色素瘤的病理生理学提供了新的线索。
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影响因子:7.519 期刊 :Oncogene 合作技术:载体构建
【研究内容】:FEN1是多功能的,含特殊结构的核酸酶,它在维持人基因组的稳定性中有重要作用。人癌症样本中,检测到有FEN1突变的,这种突变显示基因组的稳定性变差和癌变倾向。然而,FEN1功能缺失与癌症易感性的关系并不清楚。在本研究中,作者发现了新的与直肠癌相关的FEN1突变,L209P。该突变缺乏FEN1的侧翼内切酶活性、外切酶活性及缺口内切酶活性,但保留了DNA结合特性。体内和体外实验表明,L209P突变子能干扰野生型FEN1的功能。且表达L209P突变的细胞,对基因损伤更敏感,从而导致细胞内基因组的不稳定和细胞转化;同时,移植L209P突变细胞的模型小鼠会长出肿瘤。这些数据表明,人癌症相关FEN1遗传改变,非常有利于癌症的发展。
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影响因子:11.878 期刊 :Nature Communication 合作技术:shRNA慢病毒载体构建
【研究内容】:这项研究发现HBV相关性肝细胞癌患者肿瘤中的SALL4或PD-L1表达与miR-200C水平呈负相关,且SALL4或PD-L1水平低而miR-200C水平高的患者生存期较长。高水平的miR-200C直接靶向CD274 (编码PD-L1)来降低其表达,并逆转抗病毒CD8+T细胞的耗竭。作者发现,成年期HBV诱导导致STAT3激活,使SALL4蛋白重新表达,从而抑制miR-200c转录。HBV-pSTAT3-SALL4-miR-200C信号通路可调节PD-L1的表达,针对该通路的治疗策略可能会逆转病毒诱导的免疫衰竭。
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影响因子:28.467 期刊 :Nature Methods 合作技术:LC-MS/MS蛋白质谱鉴定
【研究内容】:本研究报道了特有囊泡运输调控蛋白FREE1蛋白穿梭入核,在转录水平调控植物ABA信号的全新功能,并揭示了其作用机制。在本研究中,作者发现脱落酸(ABA)处理会导致部分FREE1蛋白被SnRK2蛋白激酶磷酸化修饰并进入细胞核,在细胞核内FREE1蛋白会与ABA信号途径的重要转录因子ABI5等互作并抑制其转录激活活性。其中,为了验证FREE1蛋白中受ABA影响的磷酸化位点,作者用ABA处理样本后,采用IP方法富集了FREE1和FREE1突变体,之后用LC-MS/MS技术检测了FREE1及其突变体的磷酸化位点。
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影响因子:17.728 期刊 :Nature Cell Biology 合作技术:LC-MS/MS蛋白质谱鉴定
【研究内容】:通过分析转录抑制复合物NCoR/SMRT在不同细胞环境中的作用,发现该抑制复合物作为体细胞重编程中新的限制因素,对重编程因子诱导的相关基因表达调控起了至关重要的抑制作用,涉及的具体机制是该复合物中组蛋白去乙酰化酶HDAC3对目的基因进行了特异性组蛋白去乙酰化修饰,从而导致重编程因子无法有效地激活内源性的多能性基因。
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影响因子:11.059 期刊 :Journal of Hematology & Oncology 合作技术:RNA pull-down MS结合蛋白鉴定、RNA pulldown
【研究内容】:本研究发现了一个长链非编码RNA(LncRNA)——LAMP5-AS1,研究了其与MLL白血病发展和白血病细胞维持干细胞性的功能相关性,通过RNA pull down、FISH等一系列实验证明了LAMP5-AS1与DOT1L甲基转移酶活性的关系,并对LAMP5-AS1干扰/过表达情况下DOT1L下游靶基因的甲基化修饰水平进行了检测。该研究证实了LAMP5-AS1在MLL白血病细胞的自我更新过程和分化阻滞中所起的重要作用,其对维持DOT1L在MLL白血病中的高酶活性具有重要意义,可能成为治疗MLL白血病的一个有价值的靶点。
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影响因子:8.378 期刊 :Cancer Research 合作技术:免疫共沉淀(Co-IP)、LC-MS/MS蛋白质谱鉴定
【研究内容】:糖代谢异常是癌症的突出特征,然而有关糖原调节的异常很少被研究。本研究证明了糖原合成酶2(GYS2)通过p53的负反馈调节环来限制乙肝病毒相关性肝癌的生长。GYS2在HCC中的表达明显下调,并与糖原含量降低和不良患者预后相关。GYS2的低表达可通过调控p53来促进细胞体外增殖和体内肿瘤生长。GYS2与MDM2竞争性结合,阻止MDM2介导的p53泛素化和降解;GYS2还增强了p300诱导的p53蛋白K373/382位点的乙酰化,进而负反馈抑制了HBx/HDAC1复合物支持下的GYS2转录。研究结果提示:GYS2在HCC中作为一个预后因子和肿瘤抑制因子发挥作用,本研究中发现的HBx/GYS2/P53信号通路能够调节糖原代谢,为肝癌的临床治疗提供了一个有前途的治疗靶点。