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影响因子:10.787 期刊 :Redox Biology 合作技术:iTRAQ蛋白质组学
【研究内容】:产前母亲压力与分娩不良有关,比如早产、婴儿死亡率高或出生体重低等。母体压力引起的胚胎骨发育不良是一种典型的发育障碍,被认为是氧化应激损伤导致的,但其具体机制尚不明确。子宫发生内源性氧化还原反应或受到外源刺激都会形成各种自由基(如烷氧基自由基)并传递给胚胎,使胚胎受到氧化损伤。本研究证明了烷氧基自由基诱导产前骨生长迟缓和软骨细胞凋亡的相关信号通路:烷氧基自由基通过胚胎中铁介导的芬顿反应导致软骨细胞中氧化磷脂的显著积累,此外脂质过氧化终产物4-HNE的作用,它与关键的软骨形成转录因子SOX9形成加合物,导致其降解,从而抑制软骨形成。
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影响因子:11.878 期刊 :Nature Communication 合作技术:shRNA慢病毒载体构建
【研究内容】:这项研究发现HBV相关性肝细胞癌患者肿瘤中的SALL4或PD-L1表达与miR-200C水平呈负相关,且SALL4或PD-L1水平低而miR-200C水平高的患者生存期较长。高水平的miR-200C直接靶向CD274 (编码PD-L1)来降低其表达,并逆转抗病毒CD8+T细胞的耗竭。作者发现,成年期HBV诱导导致STAT3激活,使SALL4蛋白重新表达,从而抑制miR-200c转录。HBV-pSTAT3-SALL4-miR-200C信号通路可调节PD-L1的表达,针对该通路的治疗策略可能会逆转病毒诱导的免疫衰竭。
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影响因子:23.168 期刊 :Journal of Hematology & Oncology 合作技术:RNA pull-down MS结合蛋白鉴定、RNA pulldown
【研究内容】:本研究发现了一个长链非编码RNA(LncRNA)——LAMP5-AS1,研究了其与MLL白血病发展和白血病细胞维持干细胞性的功能相关性,通过RNA pull down、FISH等一系列实验证明了LAMP5-AS1与DOT1L甲基转移酶活性的关系,并对LAMP5-AS1干扰/过表达情况下DOT1L下游靶基因的甲基化修饰水平进行了检测。该研究证实了LAMP5-AS1在MLL白血病细胞的自我更新过程和分化阻滞中所起的重要作用,其对维持DOT1L在MLL白血病中的高酶活性具有重要意义,可能成为治疗MLL白血病的一个有价值的靶点。
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影响因子:10.183 期刊 :Mol Ther Nucleic Acids 合作技术:SILAC标记定量蛋白组学、免疫共沉淀Co-IP MS
【研究内容】:miR-181a在白血病特别是慢性粒细胞白血病(CML)中表达下调,并影响疾病发展、耐药性和预后,但其靶基因的分子机制尚不清楚。该文章通过基因芯片和SILAC蛋白组学等方法联合分析,发现PPFIA1是miR-181a的直接靶基因。当敲低细胞中的PPFIA1后,KIT信号分子的磷酸化水平明显下调。另外,CoIP-MS实验发现,PARP1会结合PPFIA1,并通过激活核受体kappa B(NF-kB)-P65的表达而上调KIT蛋白;抑制PPFIA1或PARP1能够下调c-KIT水平,抑制CML细胞生长,并延长小鼠存活期。总的来说,该研究揭示了miR-181a/PPFIA1/PARP1/NFkB-P65/KIT的分子调节轴,并提出PPFIA1和PARP1可能是潜在的CML治疗靶点。
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影响因子:7.519 期刊 :Oncogene 合作技术:载体构建
【研究内容】:FEN1是多功能的,含特殊结构的核酸酶,它在维持人基因组的稳定性中有重要作用。人癌症样本中,检测到有FEN1突变的,这种突变显示基因组的稳定性变差和癌变倾向。然而,FEN1功能缺失与癌症易感性的关系并不清楚。在本研究中,作者发现了新的与直肠癌相关的FEN1突变,L209P。该突变缺乏FEN1的侧翼内切酶活性、外切酶活性及缺口内切酶活性,但保留了DNA结合特性。体内和体外实验表明,L209P突变子能干扰野生型FEN1的功能。且表达L209P突变的细胞,对基因损伤更敏感,从而导致细胞内基因组的不稳定和细胞转化;同时,移植L209P突变细胞的模型小鼠会长出肿瘤。这些数据表明,人癌症相关FEN1遗传改变,非常有利于癌症的发展。
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影响因子:13.312 期刊 :Cancer Research 合作技术:CoIP(免疫共沉淀)、Co-IP MS、生物信息学分析
【研究内容】:前期研究发现,胆固醇能够引起前列腺癌细胞中的APMAP和EGFR蛋白在脂筏上积累并促进细胞发生EMT, 并且APMAP通过EGFR起作用,但具体如何作用呢?在本研究中,作者利用Co-IP-MS筛选方法,试图找到APMAP的结合蛋白。当在细胞中过表达APMAP-3*FLAG后,采用flag抗体做Co-IP实验,质谱检测富集到的蛋白成分,并结合生物信息学分析,找到了与APMAP相互作用的蛋白EPS15R;经过一系列基因表达、细胞功能检测,最终验证了APMAP/EPS15R/EGFR通路,即APMAP和EPS15R复合物调控了EGFR蛋白的稳定性,进而影响前列腺癌细胞的EMT。
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影响因子:9.685 期刊 :Cell Death & Disease 合作技术:iTRAQ蛋白质组学
【研究内容】高脂肪饮食(HFD)与结直肠癌(CRC)的发展有关。Toll样受体4 (TLR4)是一种跨膜的受体蛋白,能识别病原体并与之结合,启动先天免疫。已知TLR4在结直肠癌(CRC)中过表达,促进了肿瘤的生长、转移。棕榈酸可以激活TLR4,但棕榈酸是否影响CRC中TLR4的表达尚不清楚。在本研究中,脂质组学和转录组学数据显示,高脂肪饮食不仅增加了CRC小鼠模型的肿瘤重量,还增加了棕榈酸水平和TLR4表达。棕榈酸通过PU.1蛋白调控TLR4的表达。iTRAQ蛋白质组学数据显示,TLR4敲低改变了肿瘤组织中的代谢酶谱,从而完全消除了高脂肪饮食对ATP产生和肿瘤生长的促进作用。
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影响因子:6.304 期刊 :Cell Death and Disease 合作技术:载体构建
【研究内容】:本研究发现,人黑色素瘤中TLR4的表达与STAT3的激活/磷酸化呈正相关,TLR4配体通过MYD88和TRIF激活黑色素瘤细胞中的STAT3,促进了肿瘤的生长、血管生成、上皮-间充质转化(EMT)和免疫抑制肿瘤微环境的形成。当抑制黑色素瘤中STAT3的功能时,TLR4激活产生的效应减弱,说明STAT3激活对TLR4信号介导的黑色素瘤发展至关重要,为黑色素瘤的病理生理学提供了新的线索。
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影响因子:13.312 期刊 :Cancer Research 合作技术:GST pull down WB、免疫共沉淀(Co-IP)
【研究内容】:本研究利用基因过表达/干扰、双荧光素酶实验、Co-IP和GST pull down等技术证明了糖原合成酶2(GYS2)通过p53的负反馈调节环来限制乙肝病毒相关性肝癌的生长。GYS2在HCC中的表达明显下调,并与糖原含量降低和不良患者预后相关。GYS2的低表达可通过调控p53来促进细胞体外增殖和体内肿瘤生长。GYS2与MDM2竞争性结合,阻止MDM2介导的p53泛素化和降解;GYS2还增强了p300诱导的p53蛋白K373/382位点的乙酰化,进而负反馈抑制了HBx/HDAC1复合物支持下的GYS2转录。研究结果提示:GYS2在HCC中作为一个预后因子和肿瘤抑制因子发挥作用,本研究中发现的HBx/GYS2/P53信号通路能够调节糖原代谢,为肝癌的临床治疗提供了一个有前途的治疗靶点。
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影响因子:11.816 期刊 :JNCI J Natl Cancer Inst 合作技术:LC-MS/MS蛋白质谱鉴定
【研究内容】:环状RNA(circRNA) 在组织发育、基因调控和癌症发生中起着重要作用,但其是否编码功能蛋白仍不清楚。本研究对胶质母细胞瘤标本及正常脑组织进行了circRNA深度测序,用Northern-blot、Sanger测序、抗体和LC-MS/MS检测证实了circ-FBXW7及其编码蛋白的存在。进一步的功能研究显示circ-FBXW7编码的小肽能抑制癌细胞的增殖和细胞周期加速,其通过拮抗USP28诱导的c-Myc稳定作用降低了c-Myc的半衰期。临床数据表明,circ-FBXW7和FBXW7-185aa对脑癌具有潜在的预后意义。
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影响因子:5.314 期刊 :Molecular Oncology 合作技术:慢病毒包装
【研究内容】:作者发现FEN1在肺癌细胞中高表达,是碱基切除修复通路的重要组分,在维持基因组稳定性方面发挥重要作用。FEN1对肺癌细胞增殖来说很关键,抑制FEN1会导致DNA复制能力下降和DNA损伤积累,最终引发凋亡。FEN1量的改变还会影响肺癌细胞对化疗药物的响应。在小鼠实验中,FEN1抑制剂的使用也能够阻碍肺癌的发展。因此,该研究指出FEN1的有效利用可能会为肺癌靶向治疗提供帮助。
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影响因子:8.756 期刊 :Oncogene 合作技术:RNA pull-down MS结合蛋白鉴定、RNA pull down
【研究内容】:鼻咽癌(NPC)是一种起源于鼻咽腔粘膜的上皮恶性肿瘤,本研究发现LINC01503在NPC中高表达并与不良预后有关,在体外促进NPC细胞的增殖,迁移和侵袭,在体内促进肿瘤的生长和转移。LINC01503募集了富含脯氨酸和谷氨酰的剪接因子胺(SFPQ)来激活Fos like 1(FOSL1)转录,而FOSL1的过表达逆转了LINC01503敲低对NPC进展的抑制作用。此外,雄激素受体(AR)介导的转录激活是NPC细胞中LINC01503过表达以及AR配体依赖性细胞生长、迁移和侵袭的原因。这些发现表明,AR诱导的LINC01503可以通过SFPQ-FOSL1通路促进NPC发展,或成为新的NPC预后标志物和治疗靶标。