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影响因子:13.263 期刊 :Plant Biotechnology Journal 合作技术:iTRAQ蛋白质组学
【研究内容】:本研究探讨了淀粉水果“香蕉”在成熟过程中的淀粉降解机制。首先,研究者从香蕉果实中鉴定得到了38个编码淀粉降解相关蛋白的基因序列,发现在香蕉果实成熟过程中,伴随着淀粉向糖的转化过程,其中27个候选基因的水平显著升高。此外,基于iTRAQ的蛋白质组学实验鉴定了18种与淀粉颗粒表面结合的淀粉降解相关酶,其中10种在成熟过程中显著上调。另外针对MaGWD1启动子的酵母单杂交筛选到了一种转录因子bHLH,电泳迁移率分析、染色质免疫沉淀(ChIP)和瞬时表达实验证实,MabHLH6通过识别启动子中存在的E-box(CANTG)基序,激活11个淀粉降解相关基因的启动子。总之,这些发现表明香蕉果实成熟过程中的淀粉降解可能归因于转录和翻译水平上与淀粉分解相关的许多酶的复杂作用,并且MabHLH6可能通过直接激活一系列淀粉降解相关基因而作为该过程的积极调节者。
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影响因子:4.831 期刊 :Aging-US 合作技术:载体构建
【研究内容】:某些基质金属蛋白酶(MMP)的高表达与癫痫密切相关。本研究发现ILF3-AS1在颞叶癫痫(TLE)患者的海马和血清中水平升高,ILF3-AS1通过靶向miR-212诱导炎性细胞因子和MMP3、MMP9的表达。值得注意的是,针对ILF3-AS1/miR212/MMP3/9轴的治疗策略可能是治疗TLE的有效方法。
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影响因子:7.449 期刊 :Molecular Oncology 合作技术:RNA pull down MS
【研究内容】:鼻咽癌中超过70%的患者最初被诊断为局部晚期疾病,约20%的鼻咽癌患者在治疗后出现远处转移或局部复发的情况。急需探索NPC进展的机制,以确定NPC患者的有效治疗靶点。
长非编码RNA(lncRNA)没有编码蛋白质功能,但可以作为其他生物分子的信号、诱饵、引物或支架,构成一个巨大而精细的调节系统。之前的微阵列筛选显示,LINC00173在NPC组织中显著上调,本研究通过RNA pull down实验筛选并验证了LINC00173的互作蛋白RAB1B,阐明了LINC00173通过RAB1B的胞外转运功能,促进PA2G4或SDF4分泌,在体内和体外促进NPC细胞的增殖、迁移和侵袭的分子机制。
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影响因子:5.168 期刊 :Oncotarget 合作技术:iTRAQ蛋白质组学分析、itraq
【研究内容】:本研究使用基于iTRAQ的LC-MS/MS技术比较了蛋白质在弓形虫三种生命周期形式(卵囊、速殖子和含缓殖子的包囊)中的丰度,研究结果揭示了这种寄生虫在三个生活周期阶段的蛋白质表达的差异,为了解这些生活周期形式对其栖息地的适应机制提供了新的见解。
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影响因子:4.362 期刊 :Oncol Res 合作技术:慢病毒载体构建,慢病毒包装,稳转细胞株构建
【研究内容】:本研究首次探讨了Maff在HCC中的作用,并揭示了一个新的circ-ITCH/miR-224-5p/MafF调控通路。研究发现Maff在肝癌组织和细胞中呈下降趋势,慢病毒介导的Maff过表达抑制肝癌细胞增殖,诱导细胞凋亡。RNA pull down实验表明,CIRC-itch能特异性地结合肝癌组织中的miR-224-5p;救治实验进一步阐明Maff的表达和抗肿瘤作用可能是通过CIRC-itch/miR-224-5p轴来调节的。研究证实了Maff在肝癌中的抑癌作用,为肝癌的潜在治疗靶点提供了新的视角。
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影响因子:8.756 期刊 :Oncogene 合作技术:RNA免疫共沉淀RIP,LC-MS/MS质谱鉴定
【研究内容】:淋巴结转移是宫颈癌(CCa)患者最恶性的临床特征之一,但目前尚不清楚如何有效防止淋巴管生成和抑制宫颈癌细胞的侵袭性。本研究发现circVPRBP与OGT酶竞争结合RACK1蛋白,阻碍RACK1-S122位点的O-GlcNAc修饰来使其降解,从而抑制宫颈癌淋巴结转移和淋巴管生成。
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影响因子:7.449 期刊 :Molecular Oncology 合作技术:LC-MS/MS质谱鉴定
鼻咽癌中超过70%的患者最初被诊断为局部晚期疾病,约20%的鼻咽癌患者在治疗后出现远处转移或局部复发的情况。急需探索NPC进展的机制,以确定NPC患者的有效治疗靶点。
长非编码RNA(lncRNA)没有编码蛋白质功能,但可以作为其他生物分子的信号、诱饵、引物或支架,构成一个巨大而精细的调节系统。之前的微阵列筛选显示,LINC00173在NPC组织中显著上调,本研究通过RNA pull down实验筛选并验证了LINC00173的互作蛋白RAB1B,阐明了LINC00173通过RAB1B的胞外转运功能,促进PA2G4或SDF4分泌,在体内和体外促进NPC细胞的增殖、迁移和侵袭的分子机制。
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影响因子:4.379 期刊 :Scientific Reports 合作技术:DNA pull down MS
【研究内容】:家蚕的丝腺是一种特殊的器官,它可以有效地合成丝素蛋白和丝胶蛋白,并纺出茧子。丝腺又分前丝腺、中丝腺和后丝腺,后丝腺是唯一合成丝素蛋白的部分。丝素蛋白是一种分泌性复合蛋白,约占丝绸纤维的75%,由丝素蛋白重链(FibH)、丝素蛋白轻链(Fibl)和 P25糖蛋白组成。那么,哪些因素直接参与了丝素蛋白合成调控呢?本研究聚焦调控丝素蛋白(fibH、fibL、P25)编码基因的启动子结合蛋白,利用DNA pull down MS技术筛选了幼虫第四次蜕皮期 (M4)和5龄幼虫第5天(L5D5)这两个具有代表性的发育阶段,从后丝腺中鉴定出大量fih、fibL和P25启动子的结合蛋白,并分析了M4和L5D5之间存在共同和独特结合蛋白,及它们的功能特征和相互作用关系,为了解丝蛋白基因的相关调节因子提供了新的见解。